游戏王gx按照剧情来划分，总共分为四个篇章，第一篇章是入学篇兼三幻魔篇，敌人是影丸理事长，想要利用三幻魔长生不老，第二篇章是光之波动篇，被光之波动影响的斋王想要毁灭世界，第三篇章是尤贝尔篇，第四篇章，也就是最后一个篇章是darkness篇

四个部份，一开始是一个第二个是尤贝尔，第三个黑化十代最后必叶

总共分5部，1~4部完结，第5部目前正在连载。

第一部：《游戏王朝日版》全27集，主角武藤游戏（剧场版为《真红眼黑龙》）

第二部：《游戏王DM》全224集，主角武藤游戏（剧场版为《光之金字塔》）

第三部：《游戏王GX》全180集，主角游城十代（无剧场版）

第四部：《游戏王5DS》全154集，主角不动游星（剧场版为《超融合！超时空的羁绊》）

第五部：《游戏王ZEXAL》现在更新至12集，主角九十九游马（目前无剧场版）

现在一共有5部

主角分别是

游戏王

武藤

游戏

主要是上级召唤，三幻神，魔术师卡组，有黑暗游戏

游戏王GX

游城

十代

主打融合召唤，英雄卡组，有黑暗游戏

游戏王5Ds

不动

游星

主打同调召唤【前作没有的新召唤方式】废品卡组，新的决斗方式骑乘决斗，黑暗游戏露脸了游戏王zexal

九十九

游马

主打超量召唤【前作没有的新召唤方式】超量怪兽NO卡以及异热同心武器

游戏王arcv

榊

游矢

主打灵摆召唤【前作没有的新召唤方式】并且新的决斗方式动作决斗